牡丹江医学院药学院始建于2003年，是黑龙江省东南部地区高级药学人才培养基地。经过多年的建设与发展，药学学科为黑龙江省省级重点（培育）学科，下设药学硕士专业学位授权点。学院现有制药工程、药学和药物制剂三个本科专业，其中药学专业为校级重点专业，制药工程专业为校级重点专业和特色专业。